PROTAC Linkers 連接PROTAC兩部分(一個用于識別E3泛素連接酶的小肽殘基和一個可以被靶向蛋白識別的配體)的中間連接體。連接體的長度是隨機選擇的,長度從12個碳到20多個碳不等。一個最佳的連接體會使得兩個部分(目標蛋白和E3連接酶)之間擁有最大程度的相互作用,從而導致目標蛋白的高效泛素化和最終降解。常見的如:PEGs, Alkyl-Chain and Alkyl/ether。 PEG的插入也起到了增加分子的水溶性的作用。
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